Die RMD Wasserstraßen GmbH übernimmt für die Bauherren die Planung und Abwicklung der Baumaßnahmen, einschließlich Grunderwerb, Verfahrensbegleitung, Bauüberwachung und Abrechnung. Bauherren für den Ausbau der Wasserstraße sowie für die Verbesserung des Hochwasserschutzes sind die Bundesrepublik Deutschland und der Freistaat Bayern.